Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrkcshO08795 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrkcshO08795 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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