Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcof1O08784 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tcof1O08784 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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