Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp12O08736 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Casp12O08736 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Casp12O08736 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Casp12O08736 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms