Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MttpO08601 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MttpO08601 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MttpO08601 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MttpO08601 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MttpO08601 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MttpO08601 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MttpO08601 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MttpO08601 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MttpO08601 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MttpO08601 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MttpO08601 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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MttpO08601 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MttpO08601 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MttpO08601 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MttpO08601 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms