Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MsmbO08540 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MsmbO08540 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MsmbO08540 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MsmbO08540 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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