Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20939L7N243 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms