Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1oL7MU04 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms