Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm19965J3QNY8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm19965J3QNY8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms