Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm10428J3QNV7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm10428J3QNV7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms