Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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