Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm21788J3QNH3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21788J3QNH3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21788J3QNH3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21788J3QNH3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21788J3QNH3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm21788J3QNH3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21788J3QNH3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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