Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Speer4cG3UXD1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Speer4cG3UXD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms