Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp72F8VQC1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp72F8VQC1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms