Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NpcdF8VQB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NpcdF8VQB8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms