Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc37F8VPK0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ttc37F8VPK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ttc37F8VPK0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms