Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8220F6YKI2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms