Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm17093F6XGJ4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm17093F6XGJ4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms