Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm28305F6U473 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm28305F6U473 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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