Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28374F6SG70 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms