Protein–RNA interactions for Protein: F6QKH6

Lipo5, Lipase, member O5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo5F6QKH6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lipo5F6QKH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lipo5F6QKH6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms