Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A430078G23RikE9Q7Y4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
A430078G23RikE9Q7Y4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A430078G23RikE9Q7Y4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms