Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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BC030500E9Q6W0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030500E9Q6W0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BC030500E9Q6W0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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BC030500E9Q6W0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BC030500E9Q6W0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BC030500E9Q6W0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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BC030500E9Q6W0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC030500E9Q6W0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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