Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Simc1E9Q6E9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Simc1E9Q6E9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms