Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ythdc1E9Q5K9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms