Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm20518E9Q548 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm20518E9Q548 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms