Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm17727E9Q4V7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm17727E9Q4V7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm17727E9Q4V7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm17727E9Q4V7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm17727E9Q4V7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm17727E9Q4V7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17727E9Q4V7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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