Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc71lE9Q4T4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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