Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp1E9Q368 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tarbp1E9Q368 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms