Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc171E9Q1U1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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