Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm3893E9Q1I1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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