Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r68E9Q0V3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms