Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm9972E9Q053 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9972E9Q053 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms