Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ryr1E9PZQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ryr1E9PZQ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms