Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brd1E9PZ26 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms