Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph10bE9PYQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph10bE9PYQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms