Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r177E9PXM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r177E9PXM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms