Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm5415E9PXF3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm5415E9PXF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms