Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms