Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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BC035044E0CXF8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BC035044E0CXF8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035044E0CXF8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BC035044E0CXF8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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BC035044E0CXF8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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