Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rdh8D3Z6W3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdh8D3Z6W3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms