Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms