Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms