Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm4871D3Z0W7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm4871D3Z0W7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms