Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC048679D3YXE9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms