Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20547B8JJN0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20547B8JJN0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms