Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Phf11bB4XVQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phf11bB4XVQ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms