Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms