Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppfia1B2RXQ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfia1B2RXQ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms