Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah3B2RWG3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms