Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc22a28B2RT89 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms